Diplômée de l'école de Chaillot et de l'Institut d'urbanisme de Paris XII-Créteil, Bénédicte Dussert a tout d'abord travaillé à son compte en tant qu'architecte DPLG. En 1987, elle intègre la fonction publique d'Etat. Elle était notamment en charge, de 1993 à 2003, de la mise en place du département de la communication et de l'information du ministère de l'écologie et du développement durable. Elle y a conduit la première campagne gouvernementale sur l'environnement "Merci, dit la Planète", l'animation du réseau des 250 chargés de communication des services déconcentrés du ministère et la création du premier réseau de communication interministérielle auprès du Préfet de la région Auvergne, Préfet du Puy de Dôme.
Depuis avril 2003, Bénédicte Dussert était détachée à la ville de Paris où elle a successivement été conseillère technique au cabinet du Maire sur les questions d'architecture et de patrimoine, puis a géré les musées appartenant à la ville.