L'état de remplissage des aquifères est assez contrasté : inférieur à la moyenne pour 64 % d'entre eux, égal à la moyenne pour 23 % et supérieur à la moyenne pour les 13 % restants.
La grande majorité des nappes est à la baisse, que ce soit celles qui sont fortement capacitives (nappe de la Craie, nappe des calcaires de Beauce, nappe de Champigny) ou celles qui sont plus réactives (nappes des calcaires jurassiques, nappes alluviales, socle).
Sur l'ensemble du Bassin Parisien et dans le Roussillon, plusieurs grands aquifères (nappe du Pliocène du Roussillon, nappe de Beauce, nappe des Calcaires de Champigny, nappes de la Craie) présentent même des niveaux inférieurs voire très inférieurs à la normale. Cette situation est le résultat de 5 années de déficit pluviométrique.
52 départements sont actuellement concernés par au moins un arrêté préfectoral limitant l'usage de l'eau, selon le ministère de l'Ecologie.