Durant la même période, la ligne devrait permettre d'économiser des émissions de CO2 grâce aux reports de la route et de l'air vers la nouvelle offre ferroviaire soit une moyenne d'1,2 millions de voyageurs par an. Ces économies permettront d'annuler l'empreinte carbone du projet dès sa 12e année d'exploitation.
Dans les mois prochains, cette étude sera suivie et précisée afin d'améliorer la « connaissance carbone » des opérations et de proposer des solutions de remplacement. Enfin, lors de la mise en service de la ligne en décembre 2011, le bilan de la phase d'exploitation et de maintenance fera également l'objet d'une actualisation à l'aide des données réelles.
Un guide méthodologique développé par RFF et la SNCF devrait également voir le jour pour fournir à l'Etat et aux collectivités un outil d'aide à la décision dès les études préliminaires des nouveaux projets.