Marie-Christine Premartin est ingénieure en chef des ponts, des eaux et des forêts. Elle a exercé différentes fonctions au sein des services du ministère de l'Ecologie et du développement durable dans les domaines de l'aménagement et des transports, au niveau départemental, régional, en administration centrale et dans le réseau technique.
En 2009, Marie-Christine Premartin devient Directrice générale adjointe en charge du Pôle aménagement et développement durable au Conseil général de Seine-Saint-Denis. Elle y travaillait sur les domaines de l'aménagement et du développement urbain et économique, de la voirie, des déplacements et des transports, de l'environnement et de l'écologie urbaine, de l'eau et de l'assainissement. Elle est notamment à l'origine de la mise en œuvre de l'agenda 21 du département et du Plan climat de la Seine-Saint-Denis.
Dans sa nouvelle fonction au sein de l'Ademe, Marie-Christine Premartin est chargée de "définir, impulser et mettre en oeuvre les orientations stratégiques de l'agence dans les domaines des déchets, des sols pollués et friches, de l'énergie et du climat, de l'air et du bruit, ainsi que dans les champs d'action transversale : production et consommation durables, villes et territoires durables". Elle est responsable de quatre directions : consommation durable et déchets, production et énergies durables, villes et territoires durables, et climat.