Pierre-Yves Pouliquen a fait l'essentiel de sa carrière dans les métiers de l'environnement au sein du Groupe Suez Environnement. Il débute chez SITA où il est nommé en 1997 directeur général de Scori au sein du Pôle Sita Spécialités puis il évolue 6 ans plus tard vers une responsabilité à l'échelle régionale en occupant le poste de directeur général de SITA Normandie - Picardie.
En 2007, il quitte la branche déchets du groupe Suez Environnement pour rejoindre l'entité traitement des eaux. Il prend alors la direction des activités de Degrémont France où il est en charge des domaines de la construction et des services.
Pierre-Yves Pouliquen était vice-président du Synteau depuis 2007.